Sie verknüpften die Freigabe des "Augsburgischen Bekenntnisses" mit ihrer Zustimmung zur Steuerbewilligung angesichts der drohenden Türkengefahr. An den Höfen der Habsburger ätzte man:

"Der Türke ist der Lutherischen Glück".

Dieser wies dieses Ansinnen zurück und betonte, die "Brucker Pazifikation" sei seinem Vater zu Unrecht abgetrutzt worden und nur für die Person seines Vaters abgegeben worden.

Er selber berief sich auf die Bestimmung des "Augsburger Religionsfriedens" von 1555, wonach der Landesfürst die Religion seiner Untertanen bestimmen konnte (Cuigus regio, eus et religio).

Die moralische Berechtigung eines solchen Vorgehen wird sogar von katholischen Kirchenhistorikern angezweifelt. Aber es stammt eben aus einer Zeit, in der niemand an Duldung oder Tolerierung anderer Bekenntnisse dachte.

An vielen Orten kam es jetzt zur öffentlichen Religionsänderung. Die "altgläubigen" Riten wurden abgeschafft, an ihre Stelle trat der Predigtgottesdienst und die gesonderte Abendmahlsfeier.

Dadurch ging eine reformatorische Bewegung erst in die eigentliche Reformation über, weil erst jetzt die städtischen Magistrate, evangelische Patronatsherren und zum Evangelium bekehrte Priester das Kirchen- und Schulwesen im Land neu zu ordnen begannen.

Wie weit die Reformation in Kärnten gegriffen hatte, zeigte sich  im Jahre 1566, als etwa dreißig Prediger ihr evangelisches Bekenntnis vor dem Landschaftsrat ablegten.

Die in Wittenberg gedruckte slowenische Bibelübersetzung Georg Dalmatins wurde von dort als Schmuggelgut über Villach nach Krain gebracht.

In Agoritschach bei Arnoldstein bildete sich eine kleine slowenische Gemeinde und überstand sogar die Gegenreformation.

Gegen Ende seiner Regierung beschritt er den Weg der Vermittlung und trat schließlich auf dem Konzil von Trient für den Laienkelch und die Priesterehe ein. Er erreichte aber lediglich eine halbherzige Zusage zum Laienkelch.

Die Landstände waren inzwischen allerdings gar nicht mehr an Einzelerlaubnissen interessiert, sondern drängten vehement auf eine umfassende Anerkennung des "Augsburgischen Bekenntnisses".

Nach dem Tod von Kaiser Ferdinand I. 1564 wurde eine Erbteilung des Habsburger Reiches durchgeführt. Innerösterreich - zu dem auch Kärnten zählte - ging an Erzherzog Karl, der gleich nach der Erbhuldigung betonte, es stünde ihm zu, "die Religion im Lande zu handhaben, er strebe aber Einigung und Vergleich an". Die Landstände gingen darauf nicht ein und antworteten, der Erzherzog solle sie einfach bei ihrem Bekenntnis aus dem Jahre 1530 belassen.

Wieder waren es die Stände, diesmal die steirischen, die auf einer "Versicherung" bestanden, die ihnen schließlich auch gewährt wurde. Wohl auch, weil Kaiser Maximilan II. 1568 für Nieder- und Oberösterreich dem Adel freie Religionswahl gewährt hatte.

Auf dem Landtag in Graz erklärten die Stände ihre Bereitschaft, die enormen Kriegskosten zu übernehmen, als der Erzherzog zugesagt hatte, ihnen die Rechte zu gewähren, für die sie lange gestritten hatten.

Was der Erzherzog für die Steiermark zugesagt hatte, nahmen ganz selbstverständlich auch alle anderen Stände für sich in Anspruch

Die ständische Politik hat Erfolg

So blieb ihm nichts anderes übrig, nicht nur den Herren und Rittern freie Religionswahl zuzustehen, sondern auch Märkte und Städte "in Gewissensdingen ungetrübt" zu lassen.

Diese Kirchenordnung fixierte die Lehre, regelte das gottesdienstliche Leben und umfasste auch Anweisungen an das Kirchenministerium, das die Landeskirche leiten sollte. Da sich diese Ordnung wesentlich am Augsburgischen Bekenntnis orientierte, kann man sie als klar lutherisch bewerten.

St. Egyd, Bürgerspital,

Heiliggeistkirche,  Dreifaltigkeitskirche sind

evangelisch

St. Egyd, die heutige röm.-kath. Stadtpfarrkirche, blieb vorerst die Hauptkirche. Deren Prediger wurden von den Ständen besoldet.

In der Heiligengeistkirche wurde slowenisch gepredigt.

Bald danach (1591) wurde ein neues Bürgerspital und die Dreifaltigkeitskirche (die heutige Domkirche) eingeweiht, wo ebenfalls slowenischsprachige Gottesdienste abgehalten wurden.

Die vorerst einklassige Lateinschule sollte später einmal in die erste protestantische Universität im südosteuropäischen Raum unfunktioniert werden. 1572 wurde die Schule bereits mehrklassig ausgebaut.

Der Astronom Johannes Kepler wirkte hier als Lehrer, ehe er wegen seines protestantischen Bekenntnisses ausgewiesen wurde.

Bildung als Mittel zur Religionsvertiefung

Auch in den anderen Städten und Märkten werden die Schulen ausgebaut. Lesen und Schreiben wird auch deshalb intensiv unterrichtet, um sich mit den Glaubensschriften selbständig befassen zu können. Selbst in den Dörfern stellten Bauerngemeinschaften Lehrer an, um ihrem Nachwuchs den evangelischen Glauben zu vermitteln.

Inhaltlich waren es meist Themen wie "Gesetz und Gnade", mit dem der zentrale Glaubenssatz der Reformation "Allein aus Gnade, nicht aus den Werken sind wir gerechtfertigt" (Ranten/Stmk.) oder "Schuld und Sühne" (Außenfresken von Lind/Drautal) illustriert wurden.